Organisasi Pelajar Pondok Modern (OPPM) dan Koordinator Gerakan Pramuka (KGP) merupakan dua organisasi santri terbesar di PMDG. Para santri yang menjadi pengurus di kedua organisasi tersebut mendapatkan kesempatan berharga untuk menimba ilmu keorganisasian selama masa tugas satu tahun, dengan menjalankan perannya sesuai pembagian tugas masing-masing.
Setelah satu tahun lamanya mengemban amanat yang suci sebagai pembantu Pimpinan PMDG dalam menjalankan organisasi, para pengurus OPPM dan KGP melaporkan seluruh hasil kerjanya sebagai bentuk pertanggungjawaban kepada segenap keluarga besar PMDG. Laporan tersebut sekaligus menandakan purna tugas mereka, untuk melangsungkan regenerasi kepengurusan serta memberikan kesempatan kepada generasi berikutnya mengenyam pendidikan keorganisasian. Sunnah yang sudah dijalankan sejak dulu ini sesuai dengan salah satu falsafah berorganisasi di PMDG, yaitu “Patah tumbuh hilang berganti, sebelum patah sudah tumbuh sebelum hilang sudah berganti.”
